孔奋字君鱼扶风茂陵人业。奋少从刘歆受《春秋左氏传》，歆称之，谓门人曰：“吾已从君鱼受道矣。”

遭王莽乱奋与老母`幼弟避兵河西。建武五年河西大将军窦融请奋署议曹掾，守姑臧长。八年赐爵关内侯。时天下扰乱唯河西独安，而姑臧称为富邑，通货羌胡，是日四合，每局县者，不盈数月辄致丰积。奋在职四年。财产无所增。事母孝谨虽为俭约，奉养极求珍膳。躬率妻子同甘菜茹。时天下未定士多不修节操，而奋力行清洁，为众人所笑，或以为身处脂膏，不能以自润，徒益苦辛耳。奋急立节治贵仁平，太守梁筒深相敬待，不以官属礼之，常迎于大门，引入见母。

陇蜀既平河西守令咸被征召，财货连毂，弥竟川泽。唯奋无资单车就路。姑臧吏民及羌胡更相谓曰：“孔君清廉仁贤，举县蒙恩，如何今去，不共报德！”遂相赋敛牛`马`器物千万以上，追送数百里。奋谢之而矣一无所受。既至京师除武都郡丞。时，陇西余贼傀茂等夜攻府舍，残杀郡守，贼畏奋追急，乃执其妻子，预以为质。奋年已五十唯有一子，终不顾望，遂穷力讨之。吏民感义莫不倍用命焉。贼窘惧逼急乃推奋妻子以至军前，冀当退却，而击之愈厉，遂禽灭茂等，奋妻子为所杀。世祖下诏褒美，拜为武都太守。