1956年，马山中学创办，初名绍兴县第六初级中学，校址设在绍兴县东北曹娥江畔的马山镇姚家埭村。2000年7月，因行政区域调整，马山镇并入越城区，马山中学也改名为绍兴市马山中学，成为市教委直属学校。2001年，绍兴市教委决定合并马山中学和皋埠中学。2001年9月，绍兴市教委与浙江中成建工集团签署合资办学协议，学校命名为绍兴市高级中学，于2003年开学招生。